Enajst ustanoviteljev je 5. julija 1996 pred notarjem v Murski Soboti slovesno podpisalo notarski zapis in sprejelo Akt o ustanovitvi; njim so se kot soustanovitelji kasneje pridružili še nekateri, nazadnje, v letu 2011, občine Lendava, Ljutomer in Radenci.

Ustanovitelji Ustanove dr. Šiftarjeva fundacija so:

  • dr. Ivan Vanek Šiftar z družino,
  • ZRC SAZU,
  • Univerza v Mariboru,
  • Zveza združenj borcev in udeležencev NOB v Ljubljani,,
  • Občina Cankova,
  • Občina Dobrovnik,
  • Občina Gornja Radgona,
  • Občina Moravske toplice,
  • Občina Puconci,
  • Občina Tišina,
  • Mestna občina Murska Sobota,
  • Občina Lendava,
  • Občina Ljutomer,
  • Občina Radenci,
  • MURA, d.d. Murska Sobota,
  • Zavarovalnica Triglav d.d. OE Murska Sobota,
  • Nova Ljubljanska banka d.d.,
  • Radenska d. d. Radenci.